列舉扣除額申報錯誤
納稅人採列舉扣除常見錯誤的樣態包括：申報具有對價關係或未取得法定單據之捐贈、要保人與被保險人未在同一申報戶之人身保險（非健保費）、已受有保險給付或不具醫療行為之醫藥及生育費、非原始購屋（增貸或消費性貸款）或不符合自用住宅（供出租或營業）之貸款利息及非自住房屋之租金支出。
所謂「捐贈」，從民法第407條的定義可知必須以無償為要件，實務上常見的如點光明燈、安太歲、祭改、法會等，可以說是透過宗教的儀式以獲取某些需求，這與捐助社福團體或為寺廟添油箱等無償的性質仍有不同；而無論是寺廟或是社福團體，必須依法登記才屬得收受民眾捐款的單位，政治團體及候選人則受政治獻金法的規範，其捐贈單據必須符合監察院所規定的格式。
「保險費」與非自費之「醫藥及生育費」，原則上納稅人可向國稅局查調扣除額或從申報軟體下載有關資料，但並非所有金額都能扣除。許多父母在子女年幼時會以自己為要保人，子女為被保險人向保險公司投保，當子女成年獨立申報後，往往因未共同申報而不符合資格遭剔除補稅，雖說要保人未必就是實際支付保險費之人，但現行法僅就全民健康保險放寬的情況下，或許向保險公司變更要保人會是一個解決問題的方式。其次，多數納稅人認為只要是醫療院所開立的單據都可以申報醫藥及生育費，但如該收據有不具醫療行為（如：體檢、膳食費、美容、證明書費）的部分，依法是不得扣除的；另外，受有保險給付的部分，因扣除額之立法意旨在保障人民維持基本生活所需，醫藥費若已受保險給付彌補，自不得再申報扣除，即便包括在查調扣除額中，稽徵機關仍會函請保險公司提供資料，納稅人務必自行調減。
至於「購屋借款利息」與「房屋租金支出」的申報要件都是供自住使用。許多民眾誤以為只要是以房屋為標的的貸款，都能申報購屋借款利息，實務上在利率持續探底的情況，房貸族為了減少利息支出，往往以借新還舊的方式辦理，若僅是單純轉貸（未增加貸款額度），則可全額認列；倘有增貸的部分，僅能就原始購屋借款未償還部分所支付的利息申報，例如：某甲105年未償還餘額為500萬，新借的貸款金額為1000萬，107年支付利息10萬，則僅能就10萬*未償還餘額500萬/新貸款金額1000萬，認列購屋借款利息5萬元。
短漏報所得
自103年所得稅各式憑單走向無紙化以來，多數公司已不再主動開立紙本扣繳憑單給所得人，納稅人也多以向國稅局查調所得或以申報軟體下載資料為主。然而，短漏報所得仍屬綜合所得稅常見的補稅原因，其樣態包括：漏未申報配偶或受扶養親屬之所得、短漏報非扣繳類所得及由稽徵機關逕核之所得。
納稅人向國稅局所查調的所得資料，只要扣繳單位（公司）已如期申報扣繳憑單，原則上會包括所有屬扣繳類的所得，惟納稅人有「當年度結婚或離婚」、「受扶養親屬非連續兩年相同」，其配偶及未連續申報的受扶養親屬的所得，應另外以配偶及受扶養親屬之憑證查調或下載所得。
「非扣繳類所得」如非獨資合夥組織之營利所得、執行業務者（自行執業之會計師、記帳士等）之執行業務所得、將財產出租與「個人」之租賃所得、出售房屋之財產交易所得及經營補習班之其他所得…等，都是納稅人必須主動申報的所得。另外，像是私人間因借貸關係而向地政機關就債務人之房產設定抵押權並有約定利息、將財產借與他人使用及約定租金顯較當地一般租金為低者，稽徵機關必須依所得稅法逕核相關之所得。
小叮嚀
在申報綜所稅前，務必再三確認申報資料是否正確，是否有前述的情況發生，納稅人本人、配偶及受扶養親屬有多少所得，其本身可取得資料的方式必然比稽徵機關多，倘「虛報配偶」、「虛報死亡親屬」、「夫妻未合併申報」及「短漏報所得達25萬且應補徵稅額超過1萬5千元」，納稅人在申報的隔年還會收到買1送1的處罰喔(補稅加罰)，不得不慎！
其次，採網路申報的納稅人要記得點選「申報及上傳」，並確認是否完成申報，有「檔案編號」才算成功；採人工申報的納稅人，申報書一定要送回國稅局，由國稅局人員蓋收件章，並將申報資料（電子檔或紙本）至少保存五年；反之，即屬未申報案件，若經國稅局催報仍未補報，在國稅局核定以後就不能再主張要改採列舉扣除申報。
申報的內容，有自行增加「所得及扣除額」所沒有的部分，相關證明文件務必送交國稅局；如果申報內容需要調整，在申報期間截止前，都可以透過申報軟體自行調整，系統會以最終上傳日的資料為準；超過申報期限發現錯誤，則需填寫更正申請書送交戶籍所在地的國稅局辦理更正。
綜合所得稅是採『申報制』，沒有收到「稅額試算通知書」的民眾，只代表您不符合稅額試算的條件，不代表不用申報，縱使納稅人的所得低於免稅額及扣除額，只要符合條件，國稅局都會寄送稅額試算通知書。因此，筆者建議，無論所得多少，只要有所得就要申報，無論是銀行或申請補助，有申報的納稅人才會有「核定通知書」或「納稅證明」，若民眾有購買股票或公司先預扣扣繳稅款，也必須申報才有退稅喔！
