營利事業所得稅經常會聽到稽徵機關以同業利潤率、擴大書審純益率逕核所得，在綜合所得稅同樣也有類似由稽徵機關依查得資料或財政部頒訂的標準直接核定的所得，若納稅人在接獲補稅通知時，應先瞭解該所得來源的實際情況及法律規定是否有更正的空間，再決定是否繳稅。其類型有下列幾種：
一、小規模營利事業的營利所得
獨資經營的營利事業可分為由稽徵機關查定課徵營業稅的小規模營利事業，及應辦理營利事業所得稅結算申報的營利事業。前者營業稅由稽徵機關查定的小規模營業人，是按照查定課徵營業稅的營業額，按當年度該行業營利事業擴大書審純益率（通常為6％）計算營利所得，所得格式71D，為所得查調資料提供的範圍；後者為使用發票的營業人，如屬於公司、合作社或其他法人組織，應申報並繳納營利事業所得稅，其分配的股利或盈餘，屬於54C的營利所得，有按股利8.5％計算可抵減稅額或28％分開計稅的適用，若為獨資、合夥組織，則應將申報的營利事業盈餘併入綜合所得稅計算，所得格式為71D。
實務上常見的是納稅人申報扶養其直系尊親屬，卻漏未申報該親屬經營的小規模獨資商號，而由稽徵機關依查定銷售額逕核。例如某甲每期營業稅繳納4,500元，按小規模營業人營業稅適用稅率1％且每3個月繳納一次，可反推其銷售額為150,000元，則全年銷售額為1,800,000元，若其行業適用的純益率標準為6％，則應申報營利所得108,000元（或4,500 * 24）。惟實務上也常遇到納稅人將兩個不同的稅混為一談，或已停業卻未向稽徵機關辦理停業或註銷，提醒讀者在申報所得稅時應注意本人、配偶及受扶養親屬是否有經營營利事業，如決定停業，也別忘了跟稽徵機關登記。
二、非設帳的執行業務所得
執行業務與營利所得類似，主要分為「查帳」、「非查帳」及「受僱」三類。屬查帳案件的執行業務者，在申報綜合所得稅時即應同時申報執行業務所得，並將損益表、收入明細表等資料上傳或隨綜所稅申報檢附相關附件供稽徵機關查核；非查帳案件的執行業務者，通常在申報綜所稅時會自行申報該年度受委任的案件，但有時候稽徵機關蒐集的課稅資料與納稅人申報的資料不同，此時便會產生差異，實務上承辦員多會提供「執行業務非設帳電腦核定清單」供執行業務者參考，執行業務者應負協力義務，就該清單上的案件逐一說明，例如某年已申報、屬另一位執行業務所得者的收入…等，這是目前稽徵機關對非查帳案件的正常程序，絕對不是哪個執行業務者被國稅局盯上！
最後一種類型，實務上比較常在受僱律師身上發生，主要是事務所委請某位律師擔任某個案件的委任律師，在法院的資料中，委任律師只會是該律師的名字，而不會是該事務所的名字，部分公司的法務人員也會有這種情形，當納稅人收到稅單的時候，務必請事務所或公司開立受僱證明，並就國稅局檢附的「執行業務非設帳電腦核定清單」加以說明，例如：某些案件是事務所委任該律師的案件、某些案件是該律師自行接案的案件等等。
三、私人間的借貸利息
人難免有急需用錢的時候，卻可能因為各種因素而無法向金融機構貸款，因而轉向友人借款，此時，聰明的友人為保障自己的債權，可能會請債務人提供其所有的不動產作為抵押擔保，並且向地政機關登記，約定以央行利率或契約利率等方式計算利息，此時稽徵機關就會以從地政機關蒐集來的資料，依照設定的價金及約定利息核定利息所得。
